В рамках проводимой административной реформы и во исполнение распоряжения Правительства Российской Федерации №23-р от 13.01.2005 года путем слияния центров Госсанэпиднадзора 1 апреля 2005 года создано ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Приморском крае» с пятью филиалами( Уссурийск, Лесозаводск, Дальнегорск, Арсеньев, Находка).
В результате реорганизации сеть, структура и штатная численность ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Приморском крае» существенно менялась. Были ликвидированы маломощные обособленные отделы и созданы новые филиалы.
На основании распорядительных документов Правительства РФ и приказов руководителя Роспотребнадзора (от 11.04.2006 года №206 «О федеральном медико-биологическом агенстве», от 21.08.06 № 1156-р, от 30.03.2006 года №64 «О внесении изменений в Устав Центра») с 1 июня 2006 года организованы два филиала в г. Партизанске, Спасске-Дальнем.
За период 2006-07 годы выделены пять базовых лабораторных центров на основе наиболее мощных лабораторий филиалов, имеющих широкую область аккредитации и способных обеспечить сложными исследованиями закрепленных за ними филиалов по выполнению планов лабораторных исследований территориальных отделов управления Роспотребнадзора по Приморскому краю.
В учреждении постоянно проводится работа по совершенствованию и оптимизации структуры, что позволяет обеспечить выполнение возложенных задач более квалифицированно.
В настоящее время структура ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Приморском крае» представлена филиалами в: гг. Уссурийске, Находке, Лесозаводске , Дальнегорске. Непосредственно в состав Центра входят 14 отделов и крупный испытательный лабораторный центр, в состав которого входят 13 отделений, обеспечивающий их деятельность.
Организован и действует Консультационный центр по защите прав потребителей.
Испытательный лабораторный центр аккредитован в Национальном органе системы аккредитации лабораторий, осуществляющих санитарно-эпидемиологические исследования, испытания.
ИЛЦ ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Приморском крае» внесен в единый государственный реестр органов по сертификации и испытательных лабораторий Таможенного союза, осуществляющих оценку соответствия продукции требованиям Технических регламентов Таможенного союза.
В Центре трудятся 2 кандидата медицинских наук, 1 кандидат технических наук, 5 заслуженных врачей Российской Федерации, 12 человек награждены нагрудным значком «Отличник здравоохранения».
В настоящее время ФБУЗ оказывает широкий спектр услуг населению, проводит мероприятия направленные на устранение вредных и опасных факторов среды обитания.